Analysis of the Genetic Profile of SARS-COV-2 Positive Samples from Residents in Espírito Santo Based on Nanopore Genome Sequencing.

Summary: O avanço da COVID-19 no mundo está sendo processado constantemente e até o momento contabilizam-se quase 700 milhões de casos confirmados e quase 7 milhões de vidas perdidas. O novo coronavírus apresenta-se com alta virulência e grande potencial de gerar novas variantes, devido a capacidade de sofrer mutações em seu genoma, sobretudo na proteína Spike, responsável pela interação do vírus com o hospedeiro. O sequenciamento do genoma de novas viroses, como o SARS-CoV-2, é essencial e de grande importância para minimizar novos surtos zoonóticos. Observa-se o potencial do vírus em gerar novas variantes através de mutações que ocorrem no genoma viral de forma natural, podendo alterar a estrutura e interação de proteínas estruturais e não estruturais. Novos estudos permitem rastrear o comportamento do vírus local e globalmente, conhecer sua evolução, sua rota de transmissão quanto à disseminação, e determinar sua virulência. Atualmente, novas tecnologias permitem acompanhar uma epidemia em tempo real, monitorar a evolução e eficácia de um medicamento e/ou vacina, e também contribuir com os avanços epidemiológicos. Este estudo pretende abordar o sequenciamento utilizando a tecnologia de Nanoporos em amostras de participantes residentes do estado do Espírito Santo. Este tipo de sequenciamento é capaz de realizar leituras longas e obter um resultado em curto espaço de tempo. Ademais, permite obter o máximo de informações possível sobre o patógeno, cuja característica é de grande importância para lidar com a emergência atual de saúde pública, como é o caso da COVID-19. Com o sequenciamento do SARS-CoV-2 em amostras positiva, será possível verificar como o perfil mutacional do vírus se correlaciona com as características clínicas dos pacientes, a fim de entender a evolução do vírus no estado e o efeito das mutações no genoma do vírus sobretudo com o avanço da vacinação contra a doença. Ressalta-se que esses resultados irão contribuir para o conhecimento científico na área, os quais poderão ser utilizados pelo setor público para a adoção de medidas mitigadoras para evitar o surgimento de novas zoonoses.

Starting date: 30/05/2023
Deadline (months): 36

Participants:

Role	Name
Coordinator *	SANDRA LÚCIA VENTORIN VON ZEIDLER
Researcher *	MARIANE VEDOVATTI MONFARDINI SAGRILLO
Researcher *	ROBERTA FERREIRA VENTURA MENDES
Student Doctorate *	BRENA RAMOS ATHAYDES
Vice coordinator *	TEODIANO FREIRE BASTOS FILHO