Uso da Técnica de Nanoporos para o Sequenciamento do Genoma do SARS-Cov-2 e análise da dados por Bioinformática
Resumo: O sequenciamento do genoma de novas viroses, como o coronavírus tipo 2 da síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV-2), é essencial e de grande importância para mitigar novos surtos zoonóticos. Estes são causados devido às mutações que ocorrem no genoma viral, podendo alterar a estrutura e interação de proteínas estruturais e não estruturais. Novos estudos permitem rastrear o comportamento do vírus local e globalmente, conhecer tanto sua rota de transmissão quanto a de disseminação, e determinar a sua taxa de virulência. Estudos atuais têm sido realizados utilizando técnicas de sequenciamento de primeira, segunda ou terceira geração, para permitir a leitura e análise dos nucleotídeos que compõem o genoma do vírus, tornando evidentes os benefícios de tecnologias eficazes para conhecer a composição genética do vírus no menor tempo possível. Essas novas tecnologias são capazes de monitorar uma epidemia em tempo real, monitorar a evolução e eficácia de um medicamento, o desenvolvimento de uma vacina e também os avanços epidemiológicos. Esta proposta de Projeto de Pesquisa pretende abordar o sequenciamento por Nanoporos (Oxford Nanopore Technologies), que é considerado o método mais eficiente e aplicado para sequenciar vírus que causam epidemias e analisar os resultados deste sequenciamento e de amostras já depositadas no banco de dados GISAID para o Estado do Espírito Santo. Este tipo de sequenciamento é capaz de realizar leituras longas e obter respostas de amostra em curto espaço de tempo. Ademais, permite obter o máximo de informações possível sobre o patógeno, característica esta de grande importância para lidar com a emergência atual de saúde pública, como é o caso da COVID-19.
Data de início: 01/02/2023
Prazo (meses): 48
Participantes:
Papel | Nome |
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Coordenador | GREICIANE GABURRO PANETO |
Coordenador | TEODIANO FREIRE BASTOS FILHO |
Vice-Coordenador | SANDRA LÚCIA VENTORIN VON ZEIDLER |