PREDIÇÃO, In Silico, da Regulação Pós-transcricional de Genes Envolvidos no Sistema Ubiquitina-proteassoma Via Micrornas em Carica Papaya na Meleira
Nome: LARA SILVA CARMINATI
Tipo: Dissertação de mestrado acadêmico
Data de publicação: 20/02/2018
Orientador:
| Nome | Papel |
|---|---|
| PATRICIA MACHADO BUENO FERNANDES (M/D) | Orientador |
Banca:
| Nome | Papel |
|---|---|
| SILAS PESSINI RODRIGUES | Coorientador |
| FRANCISCO MURILO ZERBINI JUNIOR | Examinador Externo |
| ALEXANDRE MARTINS COSTA SANTOS | Examinador Interno |
| PATRICIA MACHADO BUENO FERNANDES (M/D) | Orientador |
Resumo: A cultura do mamoeiro é bastante susceptível a doenças, sobretudo às viroses, o que causa uma significativa diminuição da produtividade. Uma das doenças que mais afetam a produtividade nacional é a meleira do mamoeiro, uma doença associada à infecção mista por um complexo viral composto pelo papaya meleira virus (PMeV) e papaya meleira virus 2 (PMeV2), que tem como principal sintoma a exsudação espontânea de látex aquoso e fluído em folhas e frutos. Esses sintomas só são observados após a floração, assim plantas infectadas permanecem no campo por um longo tempo, constituindo como uma fonte de inóculo. Estudos em plantas de C. papaya infectadas com o complexo PMeV já revelaram a modulação de proteínas do Sistema Ubiquitina-Proteassoma 26S (UPS), sugerindo o envolvimento desta via neste patossistema. Também já foi observado alteração na expressão de miRNAs de C. papaya durante a meleira, incluindo modulação de microRNAs que almejam genes da UPS. O presente trabalho através de analises in silico teve como objetivo avaliar a modulação do UPS em Carica papaya em resposta ao complexo PMeV através da revisão de bancos de dados de transcriptômica e proteômica obtidos de plantas infectadas em diferentes fases de desenvolvimento. Além disso, foram preditos alvos de microRNAs que fosse genes que codificam para UPS, enfatizando aqueles genes modulados durante a meleira. Identificou-se, in silico, 1.074 transcritos e 80 proteínas em C. papaya similares a proteínas de UPS de outras espécies de plantas. Além disso, relatou-se 42 genes de UPS de C. papaya modulados durante a infecção. Também foram identificados 106 miRNAs que tinham como alvo de genes relacionados com o UPS, dos quais 3 famílias almejam genes responsivos a infecção pelo complexo PMeV.
